OpenMM · AMBER14/OL15 · TIP3P · 310 K · 1 bar · PME
esperando datos…
| P / ← → | reproducir-pausa · fotograma a fotograma |
| , / . | más lento / más rápido |
| U | recargar datos (simulación en marcha) |
| clic / WASD | pilotar (Espacio/C sube-baja · Q/E rota) |
| 1 / 2 / G | vdW / varillas · iones sí/no |
| B | puentes de hidrógeno sí/no |
| R / H | recolocar cámara · panel |
| C | N | O | P |
| H | Na⁺ | Cl⁻ | |
| puente de hidrógeno (entre hebras) | |||
El RMSD mide cuánto se aparta la hélice simulada del cristal de rayos X de 1981: si se mantiene en ~1–2,5 Å, nuestra física sostiene la estructura real. El agua se simula pero no se muestra (~24.000 átomos).